गैस्ट्रोइंटेस्टाइनल स्ट्रोमल ट्यूमर (GIST) पाचन तंत्र का सबसे आम मेसेनकाइमल नियोप्लाज्म है, और कार्सिनोमा के विपरीत, इसे इसके मूल स्थान से कम और इसके आणविक परिवर्तन से अधिक परिभाषित किया जाता है। GISTs की विशाल बहुमत केवल दो रिसेप्टर टायरोसिन किनेज जीन: KIT और PDGFRA में सक्रिय उत्परिवर्तन द्वारा संचालित होते हैं। इसलिए, KIT और PDGFRA दोनों को पढ़ने वाला एक केंद्रित दो-जीन परीक्षण इन ट्यूमर को वर्गीकृत करने, पूर्वानुमान लगाने और चिकित्सा से मिलान करने के तरीके के केंद्र में बैठता है। परीक्षण के पीछे के जीव विज्ञान को समझना इसके परिणाम का अच्छी तरह से उपयोग करने की दिशा में पहला कदम है।
KIT (जिसे CD117 भी कहा जाता है) और PDGFRA बारीकी से संबंधित रिसेप्टर टायरोसिन किनेज को एन्कोड करते हैं जो सामान्य रूप से कोशिका की सतह पर बैठते हैं और केवल तभी चालू होते हैं जब उनका लिगैंड जुड़ता है। GIST में, एक एकल सक्रिय उत्परिवर्तन किनेज डोमेन को स्थायी रूप से सक्रिय विन्यास में लॉक कर देता है। यह संवैधानिक सिग्नलिंग सीधे PI3K-AKT और RAS-MAPK कैस्केड में फीड करती है, जो दो मुख्य रास्ते हैं जो कोशिका को जीवित रहने, बढ़ने और विभाजित होने के लिए कहते हैं। क्योंकि उत्परिवर्तन, न कि बाहरी विकास संकेत, ट्यूमर का इंजन है, उस किनेज को अवरुद्ध करना एक तर्कसंगत और प्रभावी चिकित्सीय रणनीति है।
इमैटिनिब, KIT और PDGFRA किनेज का एक छोटा-अणु अवरोधक, उन्नत GIST के लिए मानक प्रथम-पंक्ति चिकित्सा है, और अधिकांश KIT उत्परिवर्तन ट्यूमर को इसके प्रति संवेदनशील बनाते हैं। PDGFRA के लिए तस्वीर अधिक सूक्ष्म है: PDGFRA में D842V प्रतिस्थापन स्वाभाविक रूप से इमैटिनिब के प्रतिरोधी है, फिर भी यह अवपृतिनिब के प्रति अत्यंत संवेदनशील है, जो ठीक उसी पॉकेट के लिए डिज़ाइन किया गया एक नया एजेंट है। इसलिए, दो-जीन रिपोर्ट निदान की पुष्टि करने से कहीं अधिक करती है; यह चिकित्सक को उस एजेंट की ओर ले जाती है जिसके काम करने की सबसे अधिक संभावना है और उससे दूर जो काम नहीं करेगा।
एक संयुक्त KIT और PDGFRA मूल्यांकन आम तौर पर KIT के एक्सॉन 11 और एक्सॉन 9 हॉटस्पॉट को प्रमुख PDGFRA एक्सॉन के साथ कैप्चर करता है, प्रत्येक प्रकार को उसके कोडन और अनुमानित प्रभाव के साथ रिपोर्ट करता है। दोनों जीन के लिए वाइल्ड-टाइप वाले मामले, एक छोटा लेकिन वास्तविक उपसमूह, SDH दोष या NF1 परिवर्तन जैसे वैकल्पिक ड्राइवरों की खोज को प्रेरित करते हैं। प्रयोगशाला और खरीद खरीदार के लिए, पैनल का मूल्य इसकी सरलता में निहित है: दो जीन, एक स्पष्ट रिपोर्ट, और एक अनुमोदित लक्षित विकल्प से तत्काल लिंक।
प्रश्न: यह GIST परीक्षण किन दो जीनों की जांच करता है? ए: यह KIT और PDGFRA का आकलन करता है, दो रिसेप्टर टायरोसिन किनेज जीन जो सक्रिय उत्परिवर्तन ले जाते हैं जो गैस्ट्रोइंटेस्टाइनल स्ट्रोमल ट्यूमर के विशाल बहुमत को चलाते हैं।
प्रश्न: KIT और PDGFRA को अलग-अलग के बजाय एक साथ क्यों परीक्षण किया जाता है? ए: वे GIST के प्राथमिक, परस्पर अनन्य ड्राइवर हैं, इसलिए एक एकल संयुक्त पैनल कुशलतापूर्वक उन उत्परिवर्तनों को कवर करता है जो निदान और इमैटिनिब और अवपृतिनिब जैसे PDGFRA-विशिष्ट एजेंट के बीच विकल्प दोनों निर्धारित करते हैं।
प्रश्न: क्या KIT या PDGFRA उत्परिवर्तन का पता लगाना उपचार प्रतिक्रिया की गारंटी देता है? ए: अधिकांश KIT उत्परिवर्तन इमैटिनिब पर प्रतिक्रिया करते हैं, लेकिन PDGFRA D842V उत्परिवर्तन नहीं करता है और इसके बजाय एक अलग अवरोधक की आवश्यकता होती है; परीक्षण का परिणाम वह है जो इन परिदृश्यों को अलग करता है और चिकित्सा का मार्गदर्शन करता है।
गैस्ट्रोइंटेस्टाइनल स्ट्रोमल ट्यूमर (GIST) पाचन तंत्र का सबसे आम मेसेनकाइमल नियोप्लाज्म है, और कार्सिनोमा के विपरीत, इसे इसके मूल स्थान से कम और इसके आणविक परिवर्तन से अधिक परिभाषित किया जाता है। GISTs की विशाल बहुमत केवल दो रिसेप्टर टायरोसिन किनेज जीन: KIT और PDGFRA में सक्रिय उत्परिवर्तन द्वारा संचालित होते हैं। इसलिए, KIT और PDGFRA दोनों को पढ़ने वाला एक केंद्रित दो-जीन परीक्षण इन ट्यूमर को वर्गीकृत करने, पूर्वानुमान लगाने और चिकित्सा से मिलान करने के तरीके के केंद्र में बैठता है। परीक्षण के पीछे के जीव विज्ञान को समझना इसके परिणाम का अच्छी तरह से उपयोग करने की दिशा में पहला कदम है।
KIT (जिसे CD117 भी कहा जाता है) और PDGFRA बारीकी से संबंधित रिसेप्टर टायरोसिन किनेज को एन्कोड करते हैं जो सामान्य रूप से कोशिका की सतह पर बैठते हैं और केवल तभी चालू होते हैं जब उनका लिगैंड जुड़ता है। GIST में, एक एकल सक्रिय उत्परिवर्तन किनेज डोमेन को स्थायी रूप से सक्रिय विन्यास में लॉक कर देता है। यह संवैधानिक सिग्नलिंग सीधे PI3K-AKT और RAS-MAPK कैस्केड में फीड करती है, जो दो मुख्य रास्ते हैं जो कोशिका को जीवित रहने, बढ़ने और विभाजित होने के लिए कहते हैं। क्योंकि उत्परिवर्तन, न कि बाहरी विकास संकेत, ट्यूमर का इंजन है, उस किनेज को अवरुद्ध करना एक तर्कसंगत और प्रभावी चिकित्सीय रणनीति है।
इमैटिनिब, KIT और PDGFRA किनेज का एक छोटा-अणु अवरोधक, उन्नत GIST के लिए मानक प्रथम-पंक्ति चिकित्सा है, और अधिकांश KIT उत्परिवर्तन ट्यूमर को इसके प्रति संवेदनशील बनाते हैं। PDGFRA के लिए तस्वीर अधिक सूक्ष्म है: PDGFRA में D842V प्रतिस्थापन स्वाभाविक रूप से इमैटिनिब के प्रतिरोधी है, फिर भी यह अवपृतिनिब के प्रति अत्यंत संवेदनशील है, जो ठीक उसी पॉकेट के लिए डिज़ाइन किया गया एक नया एजेंट है। इसलिए, दो-जीन रिपोर्ट निदान की पुष्टि करने से कहीं अधिक करती है; यह चिकित्सक को उस एजेंट की ओर ले जाती है जिसके काम करने की सबसे अधिक संभावना है और उससे दूर जो काम नहीं करेगा।
एक संयुक्त KIT और PDGFRA मूल्यांकन आम तौर पर KIT के एक्सॉन 11 और एक्सॉन 9 हॉटस्पॉट को प्रमुख PDGFRA एक्सॉन के साथ कैप्चर करता है, प्रत्येक प्रकार को उसके कोडन और अनुमानित प्रभाव के साथ रिपोर्ट करता है। दोनों जीन के लिए वाइल्ड-टाइप वाले मामले, एक छोटा लेकिन वास्तविक उपसमूह, SDH दोष या NF1 परिवर्तन जैसे वैकल्पिक ड्राइवरों की खोज को प्रेरित करते हैं। प्रयोगशाला और खरीद खरीदार के लिए, पैनल का मूल्य इसकी सरलता में निहित है: दो जीन, एक स्पष्ट रिपोर्ट, और एक अनुमोदित लक्षित विकल्प से तत्काल लिंक।
प्रश्न: यह GIST परीक्षण किन दो जीनों की जांच करता है? ए: यह KIT और PDGFRA का आकलन करता है, दो रिसेप्टर टायरोसिन किनेज जीन जो सक्रिय उत्परिवर्तन ले जाते हैं जो गैस्ट्रोइंटेस्टाइनल स्ट्रोमल ट्यूमर के विशाल बहुमत को चलाते हैं।
प्रश्न: KIT और PDGFRA को अलग-अलग के बजाय एक साथ क्यों परीक्षण किया जाता है? ए: वे GIST के प्राथमिक, परस्पर अनन्य ड्राइवर हैं, इसलिए एक एकल संयुक्त पैनल कुशलतापूर्वक उन उत्परिवर्तनों को कवर करता है जो निदान और इमैटिनिब और अवपृतिनिब जैसे PDGFRA-विशिष्ट एजेंट के बीच विकल्प दोनों निर्धारित करते हैं।
प्रश्न: क्या KIT या PDGFRA उत्परिवर्तन का पता लगाना उपचार प्रतिक्रिया की गारंटी देता है? ए: अधिकांश KIT उत्परिवर्तन इमैटिनिब पर प्रतिक्रिया करते हैं, लेकिन PDGFRA D842V उत्परिवर्तन नहीं करता है और इसके बजाय एक अलग अवरोधक की आवश्यकता होती है; परीक्षण का परिणाम वह है जो इन परिदृश्यों को अलग करता है और चिकित्सा का मार्गदर्शन करता है।